Der 11-jährige Kenichi Mitsuba ist ein durchschnittlicher Junge, der zur weiterführenden Schule geht und mit seinem Studium zu kämpfen hat, er ist sehr stur und sehr faul und frustriert daher immer seine Eltern und seinen Lehrer. Er liebt es, einen einfachen Weg zu finden. Er freundet sich mit Hattori Kanzo an, einem Ninja aus dem Iga-Clan, und wird zusammen mit seinem Bruder Shinzo und seinem Ninja-Hund Shishimaru Teil der Mitsuba-Familie. Hattori hilft Kenichi bei seinen Problemen und behält ihn als guten Freund ständig im Auge. Der Hauptantagonist Kemumaki, ein Koga-Ninja und seine Ninja-Katze, Kagechiyo beunruhigt Kenichi immer, hauptsächlich wegen ihrer Fehde über ein Mädchen, Yumeko. Kenichi bittet Hattori, Rache als wiederkehrende Handlung in vielen Episoden zu nehmen. Obwohl Hattori ein guter Freund ist, kämpft Kenichi manchmal mit Hattori aufgrund von Missverständnissen, die von Kemumaki verursacht wurden. Manchmal helfen ihm Jippou, Togejirou und Tsubame.